La MRC, personne morale de droit public, est une municipalité au même titre qu'une municipalité locale. Elle est représentée par un Conseil qui exerce ses droits et devoirs et est composée des maires des 20 municipalités de son territoire plus une personne représentant la municipalité d'où est issu le préfet.
Le préfet préside le Conseil et il est élu pour un mandat de deux ans parmi les maires composant le Conseil.
Voici la composition actuelle du conseil de la MRC Bellechasse:
| Élus | Titre et municipalité |
| Hervé Blais | Préfet et maire de Saint-Damien-Buckland |
| Michel Bonneau | Préfet suppléant et maire de Saint-Anselme |
| Oneil Lemieux | Maire d'Armagh |
| David Christopher | Maire de Beaumont |
| Marcel Blais | Maire de Honfleur |
| Yvon Dumont | Maire de La Durantaye |
| Juliette Laflamme | Mairesse de Notre-Dame-Auxiliatrice-de-Buckland |
| Dominic Roy | Maire de Saint-Charles-de-Bellechasse |
| Denise Dulac | Mairesse de Sainte-Claire |
| Gaétan Labrecque | Maire suppléant et représentant de Saint-Damien-de-Buckland |
| Gilles Nadeau | Maire de Saint-Gervais |
| Yvon Bruneau | Maire de Saint-Henri |
| Martin J. Côté | Maire de Saint-Lazare-de-Bellechasse |
| Bernard Morin | Maire de Saint-Léon-de-Standon |
| Donald Therrien | Maire de Saint-Malachie |
| Gilles Vézina | Maire de Saint-Michel-de-Bellechasse |
| Claude Lachance | Maire de Saint-Nazaire-de-Dorchester |
| Pascal Fournier | Maire de Saint-Nérée-de-Bellechasse |
| Daniel Pouliot | Maire de Saint-Philémon |
| Gilles Breton | Maire de Saint-Raphaël |
| Benoît Tanguay | Maire de Saint-Vallier |